Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ATAT1Q5SQI0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAT1Q5SQI0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms