Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HABP4Q5JVS0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HABP4Q5JVS0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms