Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms