Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms