Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRDTQ58F21 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRDTQ58F21 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 993.7 ms