Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SDK2Q58EX2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms