Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms