Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6CQ53S08 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms