Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDCA8Q53HL2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms