Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms