Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms