Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPRNQ4KMQ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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