Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN20Q4JDL3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN20Q4JDL3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms