Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A8Q2Y0W8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms