Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM1Q16610 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
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