Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SGCAQ16586 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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