Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA3Q16281 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA3Q16281 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA3Q16281 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA3Q16281 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA3Q16281 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA3Q16281 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA3Q16281 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA3Q16281 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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