Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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ZNF56Q15929 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ZNF56Q15929 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ZNF56Q15929 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF56Q15929 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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ZNF56Q15929 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF56Q15929 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF56Q15929 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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