Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA1Q15788 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
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