Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX1Q15699 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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