Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF4Q15306 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms