Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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