Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC10A1Q14973 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A1Q14973 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms