Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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