Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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GBX1Q14549 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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GBX1Q14549 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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GBX1Q14549 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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GBX1Q14549 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX1Q14549 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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