Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 CYTH2-206ENST00000462117 540 ntTSL 419.11■□□□□ 0.653e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.643e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.11■□□□□ 0.333e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.323e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-211ENST00000595765 746 ntTSL 215.59■□□□□ 0.093e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 NINL-204ENST00000461642 594 ntTSL 314.8□□□□□ -0.044e-9■□□□□ 11
HLTFQ14527 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-205ENST00000460595 1026 ntTSL 314.76□□□□□ -0.053e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 FBXO44-209ENST00000475435 942 ntTSL 313.91□□□□□ -0.183e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-210ENST00000493260 4652 ntTSL 513.75□□□□□ -0.213e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-208ENST00000474049 576 ntTSL 213.36□□□□□ -0.273e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 FBXO44-206ENST00000376770 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 FBXO44-208ENST00000471895 769 ntTSL 310.96□□□□□ -0.653e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 PABPC1L-213ENST00000481196 488 ntTSL 510.5□□□□□ -0.733e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 TULP4-205ENST00000613994 433 ntTSL 37.15□□□□□ -1.263e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.33e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 TULP4-203ENST00000432358 424 ntTSL 36.68□□□□□ -1.343e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.393e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CCDC82-208ENST00000545264 557 ntTSL 25.64□□□□□ -1.513e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.833e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.642e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.414e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 35.88□□□□□ -1.474e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.373e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-204ENST00000572002 1251 ntTSL 312.49□□□□□ -0.413e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-203ENST00000570962 1310 ntTSL 211.35□□□□□ -0.593e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-207ENST00000573422 493 ntTSL 411.19□□□□□ -0.623e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.763e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-206ENST00000573020 414 ntTSL 48.96□□□□□ -0.983e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.043e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 HLF-211ENST00000575868 558 ntTSL 44.81□□□□□ -1.643e-14■□□□□ 11
HLTFQ14527 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.661e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 WDR75-203ENST00000436347 2703 ntTSL 29.36□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -11e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 WDR75-202ENST00000427960 4297 ntTSL 1 (best)4.16□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 23.78□□□□□ -1.81e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 EIF4G2-222ENST00000532120 223 ntTSL 32.47□□□□□ -2.011e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 CFLAR-202ENST00000340870 963 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 CFLAR-215ENST00000457277 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.272e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 TAF7-202ENST00000624699 517 ntTSL 37.09□□□□□ -1.271e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.456e-8■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.136e-8■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.086e-8■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.026e-8■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 FNBP4-205ENST00000526109 673 ntTSL 34.9□□□□□ -1.632e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.143e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.073e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ZNF3-215ENST00000487620 2660 ntTSL 210.77□□□□□ -0.693e-9■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ZNF3-205ENST00000413658 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-9■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-9■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.93e-9■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.153e-9■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 NEK9-210ENST00000557026 5177 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 220.41■□□□□ 0.863e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 GMDS-210ENST00000533279 817 ntTSL 511.48□□□□□ -0.573e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ELP1-203ENST00000495759 2840 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.27e-9■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.655e-14■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 03e-8■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.13e-8■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.863e-8■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.015e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.035e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.25e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)12.28□□□□□ -0.445e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 FAM157C-204ENST00000570230 2184 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 FAM157C-203ENST00000568070 480 ntTSL 310.53□□□□□ -0.723e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 CHD9-219ENST00000569225 1862 ntTSL 29.02□□□□□ -0.963e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 CHD9-214ENST00000565119 824 ntTSL 35.77□□□□□ -1.493e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 CHD9-209ENST00000564255 2896 ntTSL 53.45□□□□□ -1.863e-7■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.995e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 DEPDC1B-205ENST00000512078 1596 ntTSL 27.85□□□□□ -1.155e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.275e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ATP11A-208ENST00000459908 4516 ntTSL 211.31□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ATP11A-204ENST00000418678 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ZNF638-224ENST00000493576 1107 ntTSL 54.8□□□□□ -1.644e-8■□□□□ 10.9
HLTFQ14527 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.831e-8■□□□□ 10.8
HLTFQ14527 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.731e-8■□□□□ 10.8
HLTFQ14527 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-8■□□□□ 10.8
HLTFQ14527 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-8■□□□□ 10.8
HLTFQ14527 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.433e-6■□□□□ 10.8
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