Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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