Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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