Protein–RNA interactions for Protein: Q14409

GK3P, Glycerol kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GK3PQ14409 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GK3PQ14409 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GK3PQ14409 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms