Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARF1Q14162 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
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