Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CKAP5Q14008 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CKAP5Q14008 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CKAP5Q14008 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CKAP5Q14008 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CKAP5Q14008 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CKAP5Q14008 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CKAP5Q14008 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CKAP5Q14008 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CKAP5Q14008 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CKAP5Q14008 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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