Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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