Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms