Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B2Q13435 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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