Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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