Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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PTPRSQ13332 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
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PTPRSQ13332 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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PTPRSQ13332 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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PTPRSQ13332 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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PTPRSQ13332 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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