Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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