Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF3	Q12748	YPS6	YIR039C	1614 nt		3.22	□□□□□ -1.89
CTF3	Q12748	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	BMH2	YDR099W	822 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	TVP15	YDR100W	432 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	STE14	YDR410C	720 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YGR018C	YGR018C	330 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MDV1	YJL112W	2145 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YJL147C	YJL147C	1149 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YPT52	YKR014C	705 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	PFY1	YOR122C	381 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RED1	YLR263W	2484 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RAD18	YCR066W	1464 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	SRP68	YPL243W	1800 nt		3.21	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YME2	YMR302C	2553 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YDR029W	YDR029W	315 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YDR248C	YDR248C	582 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	CAP1	YKL007W	807 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	LTP1	YPR073C	486 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YBR090C	YBR090C	369 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	XRN1	YGL173C	4587 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MDM1	YML104C	3384 nt		3.2	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	ENA2	YDR039C	3276 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	ENA1	YDR040C	3276 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	NGG1	YDR176W	2109 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MRH1	YDR033W	963 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MAM1	YER106W	909 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	NSA2	YER126C	786 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	SMX2	YFL017W-A	234 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	DAL2	YIR029W	1032 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	SSN8	YNL025C	972 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YNL109W	YNL109W	546 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	ARL1	YBR164C	552 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	GYL1	YMR192W	2163 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	DBP10	YDL031W	2988 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YKL222C	YKL222C	2118 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	UBP8	YMR223W	1416 nt		3.19	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RGC1	YPR115W	3252 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YDL050C	YDL050C	372 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	UBC13	YDR092W	462 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	HMO1	YDR174W	741 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	PUG1	YER185W	912 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MRPL9	YGR220C	810 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	CKA1	YIL035C	1119 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	EMP70	YLR083C	2004 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	CDC37	YDR168W	1521 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	ENA5	YDR038C	3276 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	CST9	YLR394W	1449 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	TPO5	YKL174C	1857 nt		3.18	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YCG1	YDR325W	3108 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MPS1	YDL028C	2295 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	VAC8	YEL013W	1737 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	DIG2	YDR480W	972 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RMD6	YEL072W	696 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	HMF1	YER057C	390 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	LIN1	YHR156C	1023 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YNL276C	YNL276C	396 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	TSR4	YOL022C	1227 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RRP15	YPR143W	753 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YPR147C	YPR147C	915 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	CMD1	YBR109C	444 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YCL002C	YCL002C	792 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	TLC1	TLC1	1301 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YNL011C	YNL011C	1335 nt		3.17	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	POL4	YCR014C	1749 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MUS81	YDR386W	1899 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MNT3	YIL014W	1893 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	PIG2	YIL045W	1617 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YGR160W	YGR160W	612 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RPL27A	YHR010W	411 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	PEX18	YHR160C	852 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YIR040C	YIR040C	333 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RPC37	YKR025W	849 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	RPL6B	YLR448W	531 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	COX14	YML129C	213 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YOR387C	YOR387C	621 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	MUD1	YBR119W	897 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	KAR4	YCL055W	1008 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	TAF2	YCR042C	4224 nt		3.16	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.15	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.15	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.15	□□□□□ -1.9
CTF3	Q12748	ERP3	YDL018C	678 nt		3.15	□□□□□ -1.91
CTF3	Q12748	YPD1	YDL235C	504 nt		3.15	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms