Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 CUP9YPL177C 921 nt2.69□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.69□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 MNT3YIL014W 1893 nt2.69□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 CHS3YBR023C 3498 nt2.69□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 SPP382YLR424W 2127 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 PFF1YBR074W 2931 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 RPL13AYDL082W 600 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YPD1YDL235C 504 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 RUB1YDR139C 234 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 RTT105YER104W 627 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 RFA3YJL173C 369 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 RPL15AYLR029C 615 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 RIM9YMR063W 720 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 LTP1YPR073C 486 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 ADY4YLR227C 1482 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 PDC2YDR081C 2778 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 SAP1YER047C 2694 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 AVT5YBL089W 1380 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 SPT14YPL175W 1359 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 TVP15YDR100W 432 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 HMF1YER057C 390 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YLL037WYLL037W 381 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YLR339CYLR339C 552 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 KIN82YCR091W 2163 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 TOM70YNL121C 1854 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YNL011CYNL011C 1335 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 FLO11YIR019C 4104 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 SKT5YBL061C 2091 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 GUK1YDR454C 564 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 DIG2YDR480W 972 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 MIG2YGL209W 1149 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YIL174WYIL174W 228 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 RPS22AYJL190C 393 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YKR070WYKR070W 1059 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YAL064WYAL064W 285 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YLR012CYLR012C 300 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 APC9YLR102C 798 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 REC102YLR329W 795 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YOL106WYOL106W 354 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 INO4YOL108C 456 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 HAT1YPL001W 1125 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YPR027CYPR027C 834 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 PIG2YIL045W 1617 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 MRS2YOR334W 1413 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 ECM21YBL101C 3354 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 CYR1YJL005W 6081 nt2.65□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 POL4YCR014C 1749 nt2.65□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 MDM36YPR083W 1740 nt2.65□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 SRB8YCR081W 4284 nt2.65□□□□□ -1.98
RPN6Q12377 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SRB7YDR308C 423 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 MAM1YER106W 909 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YFR057WYFR057W 456 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 ERP6YGL002W 651 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 GEP7YGL057C 864 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 OST5YGL226C-A 261 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 EFG1YGR271C-A 702 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 ENV10YLR065C 546 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SRT1YMR101C 1032 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 ATP11YNL315C 957 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YOR097CYOR097C 528 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 PET20YPL159C 762 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 FRE8YLR047C 2061 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 VAC14YLR386W 2643 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RTG3YBL103C 1461 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 ERP3YDL018C 678 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YDL157CYDL157C 357 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 ERG25YGR060W 930 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YJL114WYJL114W 681 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YLR076CYLR076C 423 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RPL6BYLR448W 531 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YNL276CYNL276C 396 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 CDC55YGL190C 1581 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YMR046CYMR046C 1323 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RIX1YHR197W 2292 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 HSE1YHL002W 1359 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YJL049WYJL049W 1353 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 PEX6YNL329C 3093 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 EAP1YKL204W 1899 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 MSB2YGR014W 3921 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 BNI4YNL233W 2679 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 AXL1YPR122W 3627 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SWC4YGR002C 1431 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 NRG1YDR043C 696 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RPB9YGL070C 369 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 JIP3YLR331C 378 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SPC2YML055W 537 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YNL226WYNL226W 411 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 GCY1YOR120W 939 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YOR387CYOR387C 621 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 AFT2YPL202C 1251 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YBP2YGL060W 1926 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 EXO84YBR102C 2262 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 PSK1YAL017W 4071 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 TRM82YDR165W 1335 nt2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.9 ms