Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms