Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD3Q0VAK6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms