Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms