Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms