Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms