Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms