Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms