Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms