Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 MSN1YOL116W 1149 nt3.4□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 RBL2YOR265W 321 nt3.4□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 OAF3YKR064W 2592 nt3.4□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 MTR4YJL050W 3222 nt3.4□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SLM2YNL047C 1971 nt3.4□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 RRN6YBL014C 2685 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 FLO9YAL063C 3969 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 TAM41YGR046W 1158 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 UPF3YGR072W 1164 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YJL007CYJL007C 315 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 TMA19YKL056C 504 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 TOA1YOR194C 861 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YPL205CYPL205C 345 nt3.39□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 IMH1YLR309C 2736 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 GSC2YGR032W 5688 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 FUS2YMR232W 2034 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 ISM1YPL040C 3009 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 MRPL11YDL202W 750 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 FIN1YDR130C 876 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 TIM10YHR005C-A 282 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 NNT1YLR285W 786 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 VAM10YOR068C 345 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 EXO70YJL085W 1872 nt3.38□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YGR042WYGR042W 816 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YJL119CYJL119C 324 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 EAF6YJR082C 342 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YJR111CYJR111C 852 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YKL069WYKL069W 543 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 CMD1YBR109C 444 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SKN7YHR206W 1869 nt3.37□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 snR68snR68 136 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YDR149CYDR149C 708 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 RPA14YDR156W 414 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 HLR1YDR528W 1272 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 ECO1YFR027W 846 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YGR045CYGR045C 363 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 RPL17BYJL177W 555 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 FYV7YLR068W 456 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 RPS28BYLR264W 204 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 UBX4YMR067C 1251 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YPR077CYPR077C 372 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YBR137WYBR137W 540 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 JEN1YKL217W 1851 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 ROM1YGR070W 3468 nt3.36□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 PFK26YIL107C 2484 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 VPS53YJL029C 2469 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SLA1YBL007C 3735 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YDL187CYDL187C 330 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 FAR7YFR008W 666 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SDL1YIL167W 633 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YIR014WYIR014W 729 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 ATP18YML081C-A 180 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 IMP1YMR150C 573 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 PAI3YMR174C 207 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SWS2YNL081C 432 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 RSA1YPL193W 1146 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 VPS9YML097C 1356 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 BAR1YIL015W 1764 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 DAN4YJR151C 3486 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 NEL1YHR035W 1893 nt3.35□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 VHR1YIL056W 1923 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SPR3YGR059W 1539 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 HDA2YDR295C 2025 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 ERG11YHR007C 1593 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 TGL2YDR058C 981 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SLD5YDR489W 885 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SAE2YGL175C 1038 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YGR018CYGR018C 330 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 CIC1YHR052W 1131 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 YIL029CYIL029C 429 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 LSM1YJL124C 519 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SHH3YMR118C 591 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 RIM11YMR139W 1113 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 MRPL44YMR225C 297 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 SHG1YBR258C 429 nt3.34□□□□□ -1.87
PDR8Q06149 URA2YJL130C 6645 nt3.34□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 ASI3YNL008C 2031 nt3.34□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 LST4YKL176C 2487 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 AFR1YDR085C 1863 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 NCB2YDR397C 441 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 NTF2YER009W 378 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 CGR1YGL029W 363 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 BUD21YOR078W 645 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 DPB3YBR278W 606 nt3.33□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 MIP6YHR015W 1980 nt3.32□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 PSP1YDR505C 2526 nt3.32□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 RPS14AYCR031C 414 nt3.32□□□□□ -1.88
PDR8Q06149 YDR199WYDR199W 366 nt3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms