Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms