Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms